RSV1000R був флагманом Aprilia з 1998 року і перетворився на третє покоління зі зміною моделі в 2006 році. Конфігурація рами з сухим картером, рідинним охолодженням 60° V2 + алюмінієвий подвійний лонжерон залишилася незмінною з часів першого покоління, але технічні характеристики різних деталей продовжували розвиватися на основі технологій, отриманих в гонках. В Японії доступна тільки "заводська" модель з передньою та задньою підвіскою Öhlins та кованими алюмінієвими колісними дисками в стандартній комплектації.