959 Panigale був випущений в 2016 році як супербайк середнього класу, слідом за 848 (2008-), 848 Evo (2011-) і 899 Panigale (2014-). Як випливає зі зміни назви, робочий об'єм був збільшений у порівнянні з 899 Panigale, а двигун L-Twin Superquadro з рідинним охолодженням 959 Panigale тепер має об'єм 955 куб.см, що робить його більшим, ніж колишній флагманський 916, хоча і в середньому класі. Цей більший робочий об'єм був досягнутий за рахунок збільшення ходу поршня двигуна 899 Panigale (898 куб.см) на 3,6 мм (при тому ж 100-міліметровому діаметрі отвору). Він був встановлений на рамі монокока, а електронні елементи управління, такі як ABS, трекшн-контроль і управління гальмами двигуна, були пов'язані з трьома режимами їзди (гоночний/спортивний/вологий). Мотоцикл також був оснащений перемикачем швидкостей та зчепленням з "прогресивним механізмом самообслуговування" з ефектом "ковзаючого зчеплення". Передня і задня підвіски були повністю регульованими (передня: Showa/задня: Sachs), а маятник був двостороннім, як у 899 Panigale. Модель 959 Panigale була доступна до 2019 року, після чого з'явився новий Panigale V2 для 2020 модельного року. *На зображенні - модель, що відповідає європейському стандарту Євро-4. Така ж специфікація доступна і для Японії. Також існувала версія без глушника для регіонів з менш суворими правилами, таких як Північна Америка.