У 2015 році, коли 1199 Panigale перетворився на 1299 Panigale, а об'єм двигуна "Superquadro" був збільшений до 1285 куб.см, з'явився Panigale R, окрема серія супербайків від 1299 Panigale. type" в лінійці Ducati Superbike з 1980-х років, був омологованою моделлю для Чемпіонату світу з супербайку (SBK). Регламент SBK передбачав, що двоциліндрові двигуни не можуть перевищувати 1200 куб.см (на той час), тому робочий об'єм не міг бути збільшений, і "номер" був вилучений з назви автомобіля, і він став просто "Panigale R", розлучившись з 1299 Panigale, L-подібний двигун "Superquadro" з рідинним охолодженням об'ємом 1198 куб.см, відповідно до правил SBK, не був таким, як у його попередника 1199 Panigale R, але зі збільшеним ступенем стиснення і т.д., тепер він розвивав максимальну потужність 205 к.с., що значно перевищувало 195 к.с. у 1199 Panigale R (технічні характеристики в Японії), а його суха вага зменшилася до 162 кг, що на 3 кг менше, ніж у попередньої моделі. Суху масу зменшено до 162 кг, що на 3 кг менше, ніж у попередньої моделі. Для зменшення ваги використано карбоновий екстер'єр, титанові глушники (виробництва Akrapovic) та літій-іонну батарею. Передня і задня підвіски були електронно керовані фірмою Öhlins, а також встановлені різні електронні системи управління. ［Panigale R став останньою машиною, що пройшла омологацію SBK, яка була оснащена двигуном L-twin (двоциліндровим). На зміну йому прийшов Panigale V4R (2019) з двигуном V4 об'ємом 998 куб.см.