Fusion SE, вища версія Fusion (1986-), вперше представлена в 1994 році як "лімітована" модель в кількості лише 1,000 одиниць. У специфікацію (відмінності від Fusion) на той час входили шкіряна оббивка сидінь і задній спойлер з вбудованим світлодіодним (LED, як тоді називали) високо розташованим стоп-сигналом. В цей час на автомобілі також встановлювали високо розташовані стоп-сигнали, і злиття мотоцикла і автомобіля знайшло своє відображення в цій моделі. Fusion SE, який повинен був бути обмеженою серією, був представлений в 1996 році зі "зміною кольору". Згодом серія Fusion була вилучена з каталогу, але була відроджена (Fusion і Type X) у 2003 році на тлі подальшого буму біскутерів. Fusion SE також був відроджений як модель 2005 року на базі Fusion Type X (легка кастом-версія). У березні 2006 року вона зазнала незначних змін, а у вересні того ж року було випущено пам'ятну модель, присвячену 20-річчю від дня народження "Ф'южн". Обмежений продаж. Це була остання модель Fusion SE та серії Fusion в цілому.