XR50R був випущений у вересні 1999 року як модель 2000 року і залишався в лінійці протягом чотирьох років до 2003 модельного року, виключно для дитячої їзди по бездоріжжю. Це була друга модель Honda в якості дитячого мотоцикла, після QR50 (1989-) і Z50R (1992-). Він оснащувався горизонтальним двигуном типу Super Cub або Monkey (49 куб.см, OHC) з автоматичною 3-ступінчастою коробкою передач з відцентровим зчепленням і консольно-поворотною задньою підвіскою. Розмір коліс становив 10 дюймів спереду і ззаду, висота сидіння 550 мм, а дросельна заслінка була оснащена механізмом управління відкриттям, що робило його ідеальним в якості першого велосипеда для дітей. XR70R і XR100R передували малолітражному XR-R, але XR50R прийняв зовнішній дизайн з обтічником бака з моменту його появи; XR70R та інші отримали обтічник лише в наступному модельному році XR50R був розроблений для мотоциклістів вагою 40 кг або менше. Відзначимо, що починаючи з 2004 модельного року, CRF50F еволюціонував в CRF50F і був включений в модельний ряд. *Номерні знаки не можуть бути придбані або використані на дорогах загального користування.