DR-Z400 був гонщиком-ендуро, випущеним одночасно з DR-Z400S в квітні 2000 року. Він мав таку ж базову конструкцію, як і DR-Z400S (public road trail), включаючи 4-тактний одноциліндровий DOHC 4-клапанний двигун з рідинним охолодженням і передньо-задню роздільну напівдвійну люльку, але з системою кікстартера, і був приблизно на 16 кг легшим, ніж початкова модель DR-Z400S. DR-Z400 був змагальною машиною і не міг бути ліцензований або експлуатуватися на дорогах загального користування.