Суперспортивна модель з V-подібним двигуном 90°, що продавалася з 1998 по 2003 рік. Він був схожий на Honda VTR1000SP-1 в тому, що він народився з гоночних правил Superbike того часу, які обмежували чотирициліндрові двигуни до 750 куб.см або менше, а двоциліндрові двигуни до 1,000 куб.см або менше. Двигун був запозичений у TL1000S (1997), але повністю відрізнявся від рами, встановленої на гоночній алюмінієвій рамі з двома лонжеронами. Одним з мінусів V-подібних двигунів є те, що колісна база, як правило, довша через більшу довжину двигуна спереду назад, але на TL1000R коротка колісна база була досягнута за рахунок монтажного положення і форми головки. У 2001 році, в середині свого модельного життя, був представлений GSX-R1000 (K1), а TL1000R і GSX-R1000 стали двома флагманами літрової спортивної лінійки, але незабаром основний акцент змістився на GSX-R1000. TL1000R випускався як у вітчизняній, так і в європейській версіях, причому вітчизняна версія мала кут розкидання 24°, а європейська версія - трохи більший кут розкидання 23°.