FZS1000Fazer був представлений на виставці Intermot Munich 2000 (Німеччина) як нова модель 2001 року. На момент анонсу він називався FZS1000 і продавався в Європі як FAZER, а в Північній Америці як FZ1. Тому FZS1000 Fazer і FZ-1 були ідентичними моделями з різним призначенням. FZS1000 оснащувався рядним чотирициліндровим п'ятиклапанним двигуном DOHC з рідинним охолодженням для YZF-R1, а для поліпшення керованості інерційна маса кривошипа була навмисно збільшена на 10%. Характер був повністю змінений. Незважаючи на це, він все ще був потужним, розвиваючи максимальну потужність 143 к.с. (105,2 кВт), і продавався до 2005 модельного року як модель, яку можна було використовувати по-різному, як для повсякденного використання, так і для повномасштабної спортивної їзди. У 2004 році модель північноамериканської специфікації була представлена в Японії корпорацією Presto, яка імпортувала моделі Yamaha для зарубіжних ринків, а в 2006 році були представлені її наступники - FZ1 (гола версія) і FZ1 Feather (версія з напівкапотом, як у FZS1000). Дві наступні моделі офіційно продаються в Японії з 2008 року.