У порівнянні з двоциліндровим XS650 Special, XJ650 Special був випущений в липні 1980 року з чотирициліндровим двигуном: 653-кубовий, чотиритактний, рядний чотирициліндровий, DOHC, двоклапанний двигун з повітряним охолодженням, з приводом від вала, високопродуктивний турер. У той час термін "Special" використовувався компанією Yamaha для позначення моделей американського типу, на яких їздили в стилі "верхи на коні".