BMW F650GS - це модель GS (Gerende Strasse), яка випускалася з 2000 по 2012 рік. Приблизно 13-річний термін служби моделі можна умовно розділити на дві частини, оскільки двигуни, які використовувалися з моменту її появи у 2000 році і з 2008 модельного року і далі, дуже відрізнялися один від одного. На момент появи на ринку він оснащувався одноциліндровим двигуном з робочим об'ємом 652 куб. см, тоді як, починаючи з 2008 модельного року, він оснащувався паралельно розташованим двоциліндровим двигуном з робочим об'ємом 798 куб. см. Тим не менш, позиція початкового (на той час) рівня для моделей GS залишилася незмінною: F650GS з одноциліндровим двигуном об'ємом 652 см3, представлений у 2000 році, був наступником F650 Fan Duro (1993-) і успадкував його двигун, а також позиціонування. F650GS став наступником F650 Fan Duro (1993-). У той час R1100/150GS був хітом, і виникла потреба в розробці моделі GS, і F650GS також брав участь в ралі Париж-Дакар. 2004 модельний рік побачив незначні зміни, і двигун тепер мав дві свічки запалювання (twin plugs). На виставці EICMA в Мілані в 2007 році було представлено друге покоління F650GS з двоциліндровим двигуном об'ємом 798 куб.см. в якості нової моделі 2008 року, а оскільки одночасно з ним був представлений і F800GS (з тим же робочим об'ємом), то назва F650GS перейшла і до нього. F650GS 2008 модельного року оснащувався 19-дюймовими передніми/17-дюймовими задніми литими колесами і вертикальними вилками, в той час як його побратим F800GS мав більш позашляховий дизайн (21-дюймові F-образні колеса і вилки з виїмкою), F650 більше характеризувався як кросовер, на якому можна було їздити по дорогах і іноді по бездоріжжю. Цей характер був таким же, як і у F650 Fanduro/першого покоління F650GS, навіть незважаючи на те, що двигуни були змінені. Наступником двоциліндрової версії F650GS з 2008 року став F700GS (з 2013 року), а одноциліндровий F650GS мав ще одного наступника (G650GS, з 2012 року). Зважаючи на зміну двигунів, дещо заплутаний F650GS залишив питання наступника також заплутаним.