Hypermotard 939 є базовою моделлю в новій серії Hypermotard, представленої в 2016 році. Двигун Testastretta 11° з рідинним охолодженням, який встановлювався ще з часів його попередника Hypermotard (821), мав збільшений діаметр циліндра (хід поршня не змінився), а його робочий об'єм збільшився до 937 куб.см. Зауважимо, що основною метою такого збільшення потужності було не збільшення максимальної потужності, а виконання нових (на той час) екологічних норм Євро-4 в Європі. Від Hypermotard (821) успадкували також застосування електроприводу (RbW), вибір режимів їзди "Sport", "Urban" і "Touring", ABS і трекшн-контроль і т.д. На момент представлення моделі Hypermotard 939 SP (Hypermotard 939 SP) і Hyperstrada 939 були доступні до 2018 модельного року, а наступного року на зміну їм прийшла модель Hypermotard 950.