У 1985 році CBR400F Formula 3 був представлений 31 серпня, одразу після того, як CBR400F/Endurance зазнав незначних змін (20 серпня). Як випливає з назви, модель була безпосередньо натхненна шосейно-кільцевими перегонами TT Formula 3, які в той час проводилися в класі 400сс, і була оснащена єдиним сидінням, призначеним для одномісних мотоциклів. Чотирициліндровий рядний чотириклапанний двигун DOHC з повітряним охолодженням і подвійна рама з трубами квадратного перерізу були ідентичні CBR400F/Endurance, але кермо і сходинки були виготовлені з високоякісного дюралюмінію. 5 000 одиниць було продано обмеженою серією.