CBR400RR був представлений у січні 1988 року як наступник CBR400R (NC23). Хоча це була наступна модель, вона все ще була NC23 за типом, і позиціонувалася як еволюційна версія тієї ж моделі; під час буму гоночних реплік наприкінці 1980-х років, вона щороку зазнавала змін у специфікації, а також була привабливою для користувачів, змінивши назву моделі, щоб вона виглядала швидше. Таким чином, можна сказати, що CBR400R еволюціонував в CBR400RR, але вже NC23 (хоча модель була одна і та ж, у двох мотоциклів були різні "класифікаційні номери" для неї). Хоча CBR400R оснащувався рядним чотирициліндровим двигуном з рідинним охолодженням з кулачковим приводом, який приводив в дію розподільні вали за допомогою шестерень замість ланцюгів, його спортивні характеристики були значно покращені завдяки повному обтічнику (повному обтічнику) з відмінними аеродинамічними характеристиками і радіальними шинами як спереду, так і ззаду. У 1990 році модель зазнала повної зміни і була перейменована на NC29. Хоча базова конфігурація двигуна залишилася колишньою, впускна і випускна системи були перероблені, з майже лінійним розташуванням від повітроочисника до карбюратора і випускних отворів, а момент запалювання регулювався електронікою. Рама і підвіска також були спроектовані по-новому, з метою централізації маси (тобто не розміщувати важкі предмети так далеко від центру тяжіння кузова). У 1994 модельному році історія моделі завершилася кількома змінами в специфікації, але на той час бум гоночних реплік залишився в минулому.