Cross Cub 50, випущений в лютому 2018 року, одночасно з 110-кубовою версією був модернізований і перейменований з Cross Cub в Cross Cub 110.За основу Cross Cub 50 був взятий Super Cub 50 (AA09), який був модернізований в 2017 році, і відрізнявся від нього зняттям захисних щитків ніг, а захисний кожух фар, щілинна кришка глушника та блокоподібні шини. Базові характеристики були такими ж, як і у Cross Cub 110, але різниця полягала в тому, що 110-кубовий варіант мав стандартні 17-дюймові колеса Super Cub, в той час як Cross Cub 50 мав менші 14-дюймові колеса. Він був схожий на Little Cub, який існував у лінійці з 1997 року як варіант Super Cub 50. Перший 50-кубовий позашляховик за майже 50 років, з часів CT50 Hunter Cub (1968); у червні 2019 року була випущена версія Kumamon із зображенням Кумамона, популярного піар-персонажа префектури Кумамото, де розташований завод Honda, який займається виробництвом мотоциклів.