Super Cub C100 був оригінальним представником модельного ряду "Super Cub". Він був випущений в 1958 році (Showa 33) за ціною 55 000 ієн. Незважаючи на цифру "100" в назві, чотиритактний одноциліндровий OHV-двигун з повітряним охолодженням мав об'єм 49 см3 і потужність 4,5 к.с. Він мав автоматичне відцентрове зчеплення, характерне для серії Super Cub, і не мав важеля зчеплення на лівій ручці, що дозволяло водієві знімати ліву руку з керма. Трансмісія була триступеневою. Super Cub експортувався до США з наступного, 1959 року, а виробництво за кордоном (Тайвань) розпочалося в 1961 році.