У 1989 році КР-1 була перероблена на КР-1С. Зміна моделі була спрямована, головним чином, на покращення керованості, а діапазон потужності був розширений з 8000 об/хв до 9000 об/хв, порівняно з попередніми 9000 об/хв. Це стало можливим завдяки використанню поршнів з покриттям Defric (з низькими втратами) та електронного управління випускним пристроєм (KIPS). На базі KR-1S, з рамою і підвіскою, також модифікованими для полегшення експлуатації, через півмісяця після випуску KR-1S з'явилася SP-специфікація KR-1R. Однак, KR-1S та KR-1R були останніми копіями 2-тактних гоночних мотоциклів Kawasaki.