Ninja 1000 - модель, ексклюзивна для зарубіжного ринку, представлена для 2011 модельного року. Він побудований на базі "голого" Z1000, з кузовом, накритим обтічником і упакованим разом як турист. Z1000, на якому він базувався, еволюціонував до третього покоління в 2010 році (з повністю переглянутим чотирициліндровим двигуном з рідинним охолодженням, який був збільшений до 1043 куб.см), і Ninja 1000 був побудований на цій платформі. Назва моделі для європейського ринку було Z1000SX, і ці дві моделі були ідентичні.в 2014 році Ninja 1000 зазнав зміну моделі разом з Z1000, перетворившись на друге покоління (Z1000 був четвертим поколінням).з 2017 року він продавався як внутрішня модель в Японії, а також Незначні зміни. На виставці EICMA 2019 (Міланський міжнародний мотосалон) був представлений черговий Ninja 1000 SX (модель 2020 року). У зв'язку зі зміною назви моделі, вона розглядається як окрема модель та виокремлена в окремий розділ.