Ninja 250 дебютував у 2013 році як перероблена версія Ninja 250R, який був представлений у 2008 році і повернув популярність 250-кубових спортивних мотоциклів з повним обтічником до Японії. Ninja 250R оснащувався тим же двигуном з рідинним охолодженням і паралельним розташуванням циліндрів, але мав такі ж фари з двома лінзами і гострий дизайн кузова, як і серія Ninja з більшим робочим об'ємом. З 2015 року Ninja 250R оснащувався асистентом і прослизаючим зчепленням. Також щороку випускалися спеціальні версії, багато з яких відрізнялися лише лівреєю та графікою, але спеціальна версія KRT Winter Test Edition 2017 року мала специфічні відмінності в специфікації, такі як використання передніх та задніх радіальних шин (стандартна модель була зсувною). Ninja 300 з таким же зовнішнім виглядом також був доступний як закордонна модель, а в 250-кубовій конфігурації Ninja був також одноциліндровий, легкий Ninja 250 SL (2015). На Токійському мотосалоні восени минулого року було оголошено, що повна зміна моделі відбудеться у 2018 році, до 10-ї річниці випуску Ninja 250R, а імідж, продуктивність та оснащення будуть представлені у лютому 2018 року. Відбувся запуск нової моделі з повністю новим обладнанням.