ZRX1100 і ZRX1200-II були модернізовані, а серія ZRX1200 була запущена в 2001 році з першою напівкапотною версією ZRX. ZRX1200S був моделлю, більш пристосованою для туристичного використання, з великим обтічником на рамі, що забезпечував захист від вітру, і дволамповою фарою. Базова конфігурація була такою ж, як і у ZRX1200R у версії з бікіні-капотом. ZRX1200S продавався в Японії з 2001 року ZR1200B1 до 2004 року B4. У своєму останньому, 2004 році, ZRX1200S зазнав тих же незначних змін, що і ZRX1200R, включаючи зміни максимальної потужності та інших показників (зниження на 5 к.с., але з максимальним крутним моментом при 3500 об/хв), прийняття повномасштабних датчиків і відполірованих вихлопних труб з нержавіючої сталі. Серія ZRX1200 стала ZRX1200 Daeg в 2009 році, але напівкапотної версії не було, а за 20 років існування серії з 1997 року (ZRX1100), напівкапотні версії проіснували всього чотири роки.