Оснащений першим у світі двотактним двоциліндровим двигуном об'ємом 90 куб. см. Yamaha Autolube Twin 90 - офіційна назва (скорочено "Twin 90") Випущена в 1965 році, модель AT90 була похідною від Autolube, системи змащення з роздільною подачею мастила, що було технічним досягненням для Yamaha на той час, і робочим об'ємом 90 куб. см. Двигун був двотактним, двоциліндровим, двокабінним, з двома глушниками.