R25 був представлений на Токійському автосалоні 2013 року. Його серійною версією є YZF-R25. Виробництво здійснювалося на індонезійському заводі, а його глобальне розповсюдження почалося з продажу там у липні 2014 року. 249-кубовий 4-тактний двоциліндровий двигун з рідинним охолодженням, DOHC, 4-клапанний, рядний, з максимальною потужністю 36 к.с. при 12 000 об/хв, легкий в управлінні, незважаючи на високі оберти, і був описаний як "супер спортивний мотоцикл для повсякденного використання". Він виправдав своє гасло "супер-спорт для повсякденного використання". Версія з АБС з'явилася трохи пізніше, і в Японії було дві базові лінійки - з АБС і без неї. Спеціальна кольорова модель (Movistar Yamaha Colours), натхненна машинами MotoGP, також була доступна щороку з 2015 по 2017 рік (на момент написання статті). Також продавалася модель-брат YZF-R3 з двигуном об'ємом 320 куб.см. 11 жовтня 2018 року в Індонезії (виробнича база R25) було представлено модель з незначними змінами. Було змінено дизайн екстер'єру (в стилі машини YZR-M1 GP), змінена передня підвіска на перевернуту вилку і прийняті на озброєння світлодіодні фари. Нова модель надійшла у продаж в Японії 28 березня 2019 року. Модель 2022 року відповідає нормам викидів 2020 року, а індикаторні лампи стали світлодіодними.