YZF-R1, який дебютував в 1998 році, викликав сенсацію серед гонщиків по всьому світу як велосипед, здатний до захоплюючих атак на звивистих дорогах, таких як гірські перевали, був моделлю для заокеанського ринку, але також продавався в Японії як реімпортована модель. Оснащений чотирициліндровим п'ятиклапанним двигуном DOHC з рідинним охолодженням. YZF-R1 пережив дворічну зміну моделі в 2000, 2002 і 2004 роках, а після вдосконаленої моделі 2006 року перетворився на п'яте покоління в 2007 році. Шосте покоління (2009) прийняло колінчастий вал "Crossplane Concept" і зазнало незначних змін у 2012 році. 2015 рік побачив зміну моделі на машину MotoGP, з основним акцентом на кільцеву їзду та перегони, а не на дороги загального користування. YZR-M1 відродився як найшвидша машина на трасі, успадкувавши філософію YZR-M1. Анонсована тоді ж гоночна машина YZF-R1M виявилася найшвидшою машиною на трасі в 2015 році на гонці Suzuka 8 Hours Endurance Road Race (Сузука 8 годин витривалості), принісши Yamaha першу перемогу за 19 років і четверту поспіль перемогу до 2018 року (і другу в 2019 році). Модель 2020 року зазнала значних змін У 2020 модельному році відбулися значні зміни в двигуні, шасі, електронному управлінні та інших частинах автомобіля. Дизайн зберіг образ попередньої моделі, але, як кажуть, був більше в стилі YZR-M1, машини MotoGP того ж періоду (помітно по передній масці), а аеродинамічна ефективність також покращилася більш ніж на 5%. Він також відповідає нормам Євро-5. *YZF-R1 також був доступний як вітчизняна модель з 2009 по 2014 модельний рік. Одночасно з анонсом моделі 2020 року було також оголошено, що модель для внутрішнього ринку буде відновлена з осені 2020 року (примітка: модель була запущена в серпні 2020 року). Модель 2022 року також була доступна як обмежена серія у кольорах 60-ї річниці участі в WGP.